Breakdancer

Opis programu:
BreakDancer-1.1, released under GPLv3, is package that provides genome-wide detection of structural variants from next generation paired-end sequencing reads. It includes two complementary programs.

BreakDancerMax predicts five types of structural variants: insertions, deletions, inversions, inter- and intra-chromosomal translocations from next-generation short paired-end sequencing reads using read pairs that are mapped with unexpected separation distances or orientation.

Wersje:

Poniżej znajduje się informacja jak załadować moduł do oprogramowania:
Odnośnik do ładowania modułów

Przykładowy skrypt uruchomieniowy PBS:

Przykładowy skrypt uruchomieniowy SLURM:

Przykładowe dane wejściowe: