Control-freec

Opis programu: Control-FREEC Control-FREEC is a tool for detection of copy-number changes and allelic imbalances (including LOH) using deep-sequencing data developed by the Bioinformatics Laboratory of Institut Curie (Paris).

Control-FREEC automatically computes, normalizes, segments copy number and beta allele frequency (BAF) profiles, then calls copy number alterations and LOH. The control (matched normal) sample is optional. The program can also use mappability data (files created by GEM).

Wersje:

Name:           Control-FREEC
Version:        7.2
Platform:       x86_64
Category:       Applications/Engineering
URL             http://bioinfo-out.curie.fr/projects/freec/
Provides:       freec

Poniżej znajduje się informacja jak załadować moduł do oprogramowania:
Odnośnik do ładowania modułów

Przykładowy skrypt uruchomieniowy PBS:

Przykładowy skrypt uruchomieniowy SLURM:

Przykładowe dane wejściowe: