Gamess

Opis programu:
Jest to ogólny pakiet wykorzystywany chemii kwantowej
Wersje:

Name:		GAMESS
Version:	
Platform:	x86_64
Category:	Applications/Scientific
URL		http://www.msg.ameslab.gov/gamess/

Poniżej znajduje się informacja jak załadować moduł do oprogramowania:
Odnośnik do ładowania modułów

Przykładowy skrypt uruchomieniowy SLURM:

#!/bin/bash
#SBATCH -N 2
#SBATCH -n 56
#SBATCH --mem=4gb
#SBATCH --time=01:00:00
#SBATCH -p standard

# Ustawiamy sciezki lub ladujemy odpowiednie moduly
module load gamess/2014.R1
module load python/2.7.3

export NNODES=$SLURM_NNODES

# Ustawiamy zmienna $TMPDIR
export TMPDIR=$HOME/$SLURM_JOB_ACCOUNT/scratch/$USER/$SLURM_JOB_ID

# Ustawiamy zmienne aplikacji
export SCR=${TMPDIR}


# Ustawiamy zmienne pomocnicze
INPUT_DIR="input"
OUTPUT_DIR="output"
OUTPUT_FILE="OUTPUT"

# Tworzymy katalog tymczasowy
mkdir -p ${TMPDIR}

# Kopiowanie danych wejsciowych do katalogu wskazywanego zmienna $TMPDIR
cp ${SLURM_SUBMIT_DIR}/${INPUT_DIR}/* ${TMPDIR}

# Przechodzimy do katalogu $TMPDIR
cd $TMPDIR


# Wykonujemy obliczenia
rungms.slurm 1L2Y_singlet.inp


# Konczymy obliczenia, zawartosc katalogu $TMPDIR/output kopiujemy 
# do katalogu z ktorego zakolejkowano zadanie.
mkdir $SLURM_SUBMIT_DIR/${OUTPUT_DIR}
cp -r $TMPDIR/* $SLURM_SUBMIT_DIR/${OUTPUT_DIR}/

# Czyscimy katalog roboczy
rm -rf $TMPDIR

Poniżej znajduje się pliki które należy umieścić w katalogu input.
Plik:Example.zip