Ingap

Opis programu:
Integrative next-generation genome analysis pipeline (inGAP), which employed a Bayesian principle to detect single nucleotide polymorphisms (SNPs), small insertion/deletions (indels). inGAP has been applied to a number of genome projects, including bacteria, yeast, plants and mammals. Here we extend this pipeline to identify and visualize large-size structural variations, including insertions, deletions, inversions and translocations.

Wersje:

Name: inGAP
Version: 3.1.1
Platform: x86_64
Category: Applications/Engineering
URL: http://ingap.sourceforge.net/
Provides: inGAP

Poniżej znajduje się informacja jak załadować moduł do oprogramowania:
Odnośnik do ładowania modułów

Przykładowy skrypt uruchomieniowy PBS:

Przykładowy skrypt uruchomieniowy SLURM:

Przykładowe dane wejściowe: