Tophat
Opis programu:
TopHat is a program that aligns RNA-Seq reads to a genome in order to identify exon-exon splice junctions. It is built on the ultrafast short read mapping program Bowtie.
Wersje:
Name: TopHat Version: 2.0.12 Platform: x86_64 Category: Applications/Scientific URL http://ccb.jhu.edu/software/tophat/index.shtml
Poniżej znajduje się informacja jak załadować moduł do oprogramowania:
Odnośnik do ładowania modułów
Przykładowy skrypt uruchomieniowy PBS:
Przykładowy skrypt uruchomieniowy SLURM:
Przykładowe dane wejściowe: